棉花SSR标记在红麻中的通用性

Shusheng FANG, Xiongfeng XIE,Jianmin QI,Liemei ZHANG,Jiantang XU,Lihui LIN,Liwu ZHANG

Chinese Journal of Tropical Crops（2018）

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Abstract

红麻与棉花属于锦葵科不同属的天然纤维作物,利用棉花SSR引物的通用性可以丰富红麻SSR标记.本研究从陆地棉每条染色体上随机均匀挑选10对SSR引物,共260对,对24份不同来源的红麻种质进行多态性分析.结果显示,139对(53.5％)引物扩增出了清晰的条带,128对(49.2％)引物表现出多态性,共扩增出292条带,平均每对引物扩增出2.1条带,平均多态信息量为0.5419.表明这些引物在红麻中的通用性和多态性好.位于陆地棉染色体A1、A5和D8上的SSR引物在红麻中扩增多态性较高.聚类分析表明,24份红麻种质可分为2个类群,进一步划分为4个亚群,与地理来源和系谱关系较一致.这些结果既证实了棉花SSR引物应用于红麻是可行的,又有助于红麻与棉花比较基因组学和遗传育种研究.

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