辣椒CaDREB3基因的克隆和表达特性分析
Chinese Journal of Tropical Crops(2016)
Abstract
从构建的辣椒cDNA文库中筛选阳性克隆,测序并获得辣椒CaDREB3基因,研究该基因的亚细胞定位、瞬时表达及组织表达特性,揭示CaDREB3的功能及其在植物抗逆过程中的分子机制.应用预测软件对其进行功能及生物信息学分析,利用qRT-PCR分析CaDREB3基因的瞬时表达及在不同组织中的表达特性,并以基因枪轰击洋葱表皮的方法,对CaDREB3基因进行亚细胞定位分析.结果表明,辣椒CaDREB3长度为1 997 bp,含有1071bp的完整的开放阅读框,编码357个氨基酸,含有ERF亚族的AP2/ERF保守结构域,与西红柿(NP_001234707.1)、马铃薯(AET99101.1)及拟南芥(NP_177931.1)具有较高的氨基酸相似性,其中与西红柿的相似性最高,达83%.亚细胞定位表明该基因位于细胞核,瞬时表达表明CaDREB3可以和GCC-box结合,qRT-PCR检测表明,CaDREB3基因的相对表达量在辣椒茎、叶和果实中表达量较高.实验明确了辣椒CaDREB3基因亚细胞定位信息和组织表达情况,为进一步研究其功能及分子机制提供依据.
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