树体休眠期前苹果花芽对低温早期响应的转录组分析

[目的]从总体上了解苹果花芽早期响应低温信号的基因表达情况,以期了解苹果休眠期花芽早期反应的分子网络,从而为苹果抗冷性研究提供理论依据.[方法]于树体休眠前收集花芽,低温(4℃)处理45 min(T1)、90min(T2)和240 min(T3),常温处理为对照(T0),利用转录组技术分析了树体休眠前苹果花芽响应低温信号早期的基因表达情况,利用实时荧光定量PCR (Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)进行数据验证.[结果]与对照相比,T1、T2和T3分别获得237、508和990个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs).GO富集分析表明:处理前期的DEGs主要涉及碳水化合物有关的代谢、单体碳水化合物代谢过程,而后期主要涉及刺激反应、胁迫响应和DNA的转录等生物学过程.KEGG富集分析表明DEGs主要参与了“植物-病原菌互作”,“植物激素信号转导”等.其中,在响应低温信号后,参与钙调素/钙调素类蛋白(Ca2+-CaM/CML)代谢的基因MDP0000808334、MDP0000263349等及参与脱落酸(Abscisic acid,ABA)、油菜素内酯(Brassinosteroid,BR)和赤霉素(Gibberellin,GA)信号代谢的基因MDP0000189486、MDP0000122792和MDP0000287039等上调表达显著.[结论]Ca2+信号通路可能主要参与了苹果花芽的冷响应过程.此外,ABA、BR和GA等激素可能在苹果花芽响应低温信号中也起重要的调控作用.