柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析

分析SAUR(Small auxin up-regulated RNA)基因家族在不同柑橘基因组中的数量、连锁群分布、基因结构、系统进化、基因表达模式等,从香橼、柚、莽山野橘和克里曼丁橘等基因组中分别鉴定到69、62、58和70个SA UR基因.SA UR在基因组上分布不均,呈现明显的串联重复现象,基因家族成员的差异可能是由于串联重复和染色体大片段复制引起.大多数柑橘SA UR基因不含内含子,含有SA UR特有的4个保守motif.系统进化树分析显示,来源于拟南芥、水稻、番茄、马铃薯和柑橘的629个SA UR基因分为9组,每一组都含有5个物种的家族成员,并且同一个物种的SAUR基因具有较近的遗传距离.顺式元件分析表明,CclSA UR基因家族成员的上游序列含有光响应、转录因子结合、激素响应、伤害响应、低温响应、玉米素代谢和类黄酮生物合成相关的元件.qRT-PCR分析结果显示,大多数CclSA UR都能响应外源IAA和低温处理.