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重庆地区侵染抱子芥和茎瘤芥的病毒及其株系的分子鉴定

Acta Horticulturae Sinica(2019)

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Abstract
为了明确当前重庆地区抱子芥和茎瘤芥病毒病的病原种类和株系, 在重庆13个区县的18个乡镇采集疑似病毒感染的样品进行病毒RT-PCR检测和株系分析.结果表明:在57份抱子芥样品中, 黄瓜花叶病毒 (Cucumber mosaic virus, CMV) 、芜菁花叶病毒 (Turnip mosaic virus, TuMV) 、烟草花叶病毒 (Tobacco mosaic virus, TMV) 、马铃薯X病毒 (Potato virus X, PVX) 和芸薹黄化病毒 (Brassica yellows virus, BrYV) 的检出率分别为31.58%、85.86%、49.12%、59.65%和77.19%, 其中87.72%的样品受两种及以上病毒的复合侵染, 45.61%的样品受3种病毒的复合侵染;在41份茎瘤芥样品中, CMV、TuMV、PVX和BrYV的检出率分别为36.59%、73.17%、75.61%和70.73%, 其中80.49%的样品受两种及以上病毒的复合侵染, 51.22%的样品受3种病毒的复合侵染.对各检出病毒分离物CP基因进行扩增、序列测定和系统发育分析, 明确抱子芥和茎瘤芥中TuMV分离物归属于TuMV的World-B组;CMV分离物归属于CMV亚组Ⅰ;PVX分离物归属于PVX的X3株系;BrYV和TMV与已报道的病毒株系CP基因核苷酸序列具有很高的相似性, 存在一定的地域相关性, BrYV为重庆地区首次报道.
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Key words
virus disease,Brassica juncea var.tumida Tsen et Lee,RT-PCR,detection,identification,Brassica juncea var.gemmifera Lee et Lin
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