苹果LysM类受体激酶基因家族鉴定与表达分析

以LysM (PF01476)和Pkinase (PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,在全基因组范围比对分析了苹果(Malus×domestica Borkh.)LysM-RLK家族的成员,对其家族成员的理化性质、进化关系、染色体分布、基因结构等进行了分析;基于已公布的转录组学数据,分析了LysM-RLK基因在苹果组织、发育过程和生物胁迫中的表达情况.通过分析,共获得12个苹果LysM-RLK基因,其氨基酸序列大小介于553 ～1 053,分子量介于62.65 ～ 119.04 kD,等电点介于5.11 ～ 7.45,主要位于质膜;根据进化分析将其分为3个亚组,亚组内各成员的外显子—内含子结构呈现较为相似的特征.基因表达数据显示,苹果的4个LysM-RLK基因表达存在较大的组织特异性,7个基因在苹果腐烂病和再植病发病过程中为差异表达.