辣椒全基因组中LBD转录因子的鉴定与表达分析
Acta Horticulturae Sinica(2016)
Abstract
利用生物信息学的方法,从辣椒基因组中鉴定出45个LBD基因,这些基因分布于辣椒9条染色体上.该家族成员内含子数整体上不超过3个,结构相对简单.进化关系显示辣椒LBD基因可分为Class Ⅰ和Class Ⅱ两大类,细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类.不同组织和发育时期的表达模式研究发现,该基因家族具有一定的时空表达特异性.qRT-PCR结果表明,热激胁迫可以明显激活或抑制部分LBD基因的表达,其中Class Ⅱ类基因较Class Ⅰ类对高温具有更高的敏感性.
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LBD gene family,phylogeny analysis,gene expression,pepper
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