基于COI基因对两种粉蚧遗传差异的研究

South China Fruits(2019)

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摘要
以柑桔臀纹粉蚧Planococcus citri和大洋臀纹粉蚧Planococcus minor为材料,提取粉蚧基因组DNA,通过COI基因作为分子标记,初步分析了它们的遗传差异和遗传进化关系.结果 表明,获得两种粉蚧线粒体COI基因序列各9条,经校对编辑后序列长度为591 bp.其中T、C、A、G碱基平均含量分别为48.3%、10.3%、36.3%和5.1%.18条COI序列共定义4个单倍型,其中检测到变异位点15个,包含单一突变位点1个、简约信息位点14个.两种粉蚧的单倍型比例均为22.2%;Kimura 2-parameter遗传距离显示,种间遗传距离范围为0.001~0.024,平均遗传距离0.012.NJ进化树及ML进化树分析,两种粉蚧各自聚为1个支系.碱基替换饱和性分析显示,两种粉蚧碱基替换成线性关系,未达到饱和状态;经Tajima's D检验,大洋臀纹粉蚧种群内存在高频稀有等位基因,而柑桔臀纹粉蚧低频稀有等位基因占主导.说明两种粉蚧的系统发育趋于保守,从长远看两种粉蚧形态特征有较大的的区别需要较长时间的发育进化.
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