97个山杏无性系的遗传多样性及SSR指纹图谱

Scientia Silvae Sinicae(2018)

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摘要
[目的]山杏是北方半干旱地区重要的生态经济型树种,种质资源异常丰富,形态鉴定与分类难度大.利用SSR分子标记研究山杏优选无性系的遗传多样性并构建指纹图谱,以期为山杏种质鉴定提供科学依据.[方法]根据山杏简化基因组测序结果,合成600对SSR引物,利用4个山杏无性系进行引物筛选,选出155对扩增条带清晰的引物,对97个山杏优选无性系进行PCR扩增.应用引物组合法构建指纹图谱,采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析.[结果]利用155对SSR引物对97个山杏无性系进行扩增,共扩增出933个等位基因,每个位点的等位基因数为3~11个,平均为6.019个;各位点的多态性信息含量(PIC)为0.476~0.885,平均值为0.681,具有较高的多态性.50个山杏无性系在59个位点上具有特异等位基因,89个无性系在131个位点上具有特异基因型.采用5对引物(L56、X47H、L79H、P40H和X47)的组合可区分全部97个无性系,构建了指纹图谱.对97个山杏无性系进行亲缘关系分析,无性系间的遗传相似系数变化范围为0.669 ~0.943,平均值为0.757;基于遗传相似系数进行聚类分析,将97个无性系分为5大类,第1大类和第2大类下又分为3个亚类,分类结果与无性系的来源区域有明显的相关性.[结论]从600对SSR引物中筛选出155对,其扩增位点多态性较高、重复性较好.发现89个山杏无性系具有特异基因型,其中50个既具有特异基因型也具有特异等位基因.应用引物组合法构建了基于5对SSR引物扩增位点的山杏无性系指纹图谱.供试山杏无性系遗传差异较小,亲缘关系较近.研究结果可为山杏种质鉴别提供科学依据,也为山杏的育种工作奠定基础.
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