基于沙棘转录组序列开发EST-SSR分子标记

[目的]本研究通过对蒙古沙棘“向阳”品种的转录组序列进行 SSR 引物开发，为沙棘亲本分析、遗传多样性和遗传育种等研究提供支持。[方法]利用已测得的转录组序列进行分析和筛选，整理具有 SSR 位点的序列，进行引物设计，随机挑选179条引物进行验证。[结果]得到具有 SSR 位点的 EST 序列17383条，其中，单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复基元分别占62．77％、21．82％和13．77％；二核苷酸重复基元类型以 AT 和 AG 为主，三核苷酸重复基元类型以 AAG、ATC 和 ATA 为主。9291条序列设计出扩增 EST-SSR 位点的引物，随机合成的179对引物中，142对扩增成功，选取其中92个位点的扩增产物上机检测，40个 SSR 位点（43．48％）呈现多态。对扩增稳定且峰图清晰的17个多态位点的进一步分析，得到蒙古沙棘天然群体在各位点的观测杂合度（HO ）为0．0830．875，期望杂合度（HE）为0．1800．750。[结论]本研究开发出的 EST-SSR 标记，为后期进行沙棘属植物遗传多样性分析、遗传图谱构建及分子育种等研究提供了重要支持。