广西地区猪肠病毒G型的流行病学调查及VP1基因序列分析

为分析广西地区猪肠病毒G型(EV-G)的流行状况及分子遗传演化特征,本研究收集2017-2018年广西地区222份临床腹泻样品,进行EV-G的检测、流行病学调查及VP1基因的扩增、克隆和序列分析.流行病学调查结果显示,广西地区2017-2018年EV-G的样品阳性率为6.76％ (15/222),而猪场阳性率则高达16.98％ (9/53).值得注意的是,广西地区2017-2018年EV-G的样品阳性率从2017年的4.55％上升至2018年的10.00％,上升幅度较大.同时发现该病毒在冬春季节的检出率较高.序列同源性分析结果显示,本研究获得的2株EV-G VP1基因之间的核苷酸同源性为99.2％,氨基酸同源性为98.8％,与国内外毒株VP1基因的核苷酸同源性为62.4％～80.1％,氨基酸同源性为45.7％～71.7％.遗传进化分析显示,本研究获得的2株EV-G VP1序列在同一分支,均属于G1亚型,与美国分离株13-03212遗传关系密切.氨基酸序列比较结果显示,广西地区该2株EV-G VP1氨基酸在多个位点发生了变异.抗原指数分析显示,广西地区EV-G型流行毒株的抗原性变化较大.表明2017-2018年广西地区存在一定程度的EV-G感染,本研究结果为明确EV-G型的流行概况及EV-G型的分子特性提供了参考依据.