吉林省猪圆环病毒3型的分子流行病学调查及遗传演化分析

为了解猪圆环病毒3型(porcine circovirus type 3,PCV3)在吉林省的流行情况和分子生物学特性,本研究通过PCR方法对吉林省2015-2017年的484份血清样品进行PCV3检测,将PCV3检测阳性的样品进行ORF2基因扩增和测序,并利用生物信息学软件DNAStar和Mega 6.06对ORF2基因的分子生物学特性进行分析.结果 显示,吉林省2015-2017年PCV3样品总感染率和猪场感染率分别为28.1％(136/484)和65.8％(25/38),且呈逐年上升趋势.同源性分析结果表明,本研究获得的4株PCV3ORF2基因的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为98.3％～98.9％和97.7％～99.5％,4株PCV3ORF2基因与国内外参考毒株ORF2基因的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.7％～99.7％和96.7％～100％.遗传进化分析表明,PCV3存在2个亚群:PCV3a和PCV3b.本试验分离的PCV3毒株分别位于2个亚群上,1株属于PCV3a亚群,3株属于PCV3b亚群.PCV3毒株Cap蛋白第24(A、V)和27位(R、K)氨基酸的不同可能与PCV3毒株的进化相关.本试验结果表明,PCV3在吉林省猪群和猪场中存在很高的感染率,PCV3毒株之间高度保守,本研究结果为PCV3的分子特性研究提供了参考依据.