2013～2017年江西省猪圆环病毒2型分子流行病学调查

为掌握江西地区猪圆环病毒2型(PCV2)的分子流行病学及其遗传变异情况,本研究运用实验室已建立的PCR方法对2013～2017年采集自江西省南昌市、宜春市、新余市、赣州市、吉安市、九江市、上饶市、抚州市、景德镇市、鹰潭市等10个地区的1082份疑似PCV2感染猪病料组织进行病原学检测,并通过PCR扩增、克隆和基因测序对PCV2的全基因组序列进行分析.研究表明,1082份病料中有610份为PCV2阳性,总阳性率为56.4％,其中2013～2017年阳性率分别为52.7％ 、48.8％ 、58.5％ 、71.0％ 和67.4％.共获得89株PCV2全基因组序列,其中有83株为PCV2b基因型,其中53株归类于PCV2b-1C基因亚群,30株归为PCV2b-1A/1B基因亚群;6株为PCV2a型.测序毒株与参考毒株OR F2基因核苷酸、氨基酸序列同源性分别为88.9％ ～100.0％ 和86.0％ ～100.0％;氨基酸序列分析表明,Cap蛋白存在20个氨基酸突变位点.本研究表明,江西地区猪群中PCV2的主导基因型为PCV2b,其中又以PCV2b-1C基因亚群占据主导地位,同时也存在少量PCV2a基因型.