一株基因Ⅸ型鸭源新城疫病毒F基因的克隆及序列分析

从广东地区疑似患有新城疫的病死雏番鸭群中分离到1株新城疫病毒,命名为GD1002株.毒力测定结果表明,致死鸡胚平均死亡时间(MDT)、1日龄雏鸡脑内接种致病指数(ICPI)、6周龄鸡静脉接种致病指数(IVPI)分别为56.0 h、1.64、2.29,符合强毒株的毒力判断标准.利用RT-PCR扩增了该分离株F基因的主要功能区片段,并进行了克隆与序列分析.该分离株F蛋白裂解位点的组成为112R-R-Q-R-R-F117,具有典型新城疫强毒株的分子特征.F基因第47-420 nt片段基因分型分析表明,该流行株属于基因Ⅸ型.相似性及遗传进化分析结果表明,该分离株与基因Ⅸ型毒株F48 E9、JS/1/97/Ch和FJ/1/85/Ch株有较高同源性和较近的亲缘关系.