猪流行性腹泻病毒LN-2015-1株分离鉴定及其S基因的变异分析

为了解辽宁猪流行性腹泻病毒(PEDV)来源及变异特性,经PCR诊断,细胞分离,细胞病变观察、RT-PCR以及S基因序列鉴定,成功分离1株PEDV毒株(LN-2015-1).S基因序列分析显示,与CV777毒株相比,除点突变外,分离株还出现最长9 bp的插入,6 bp的缺失和13 bp连续突变.氨基酸也存在最长3 aa插入和2 aa缺失,同时存在4处连续3个及以上的氨基酸突变,抗原表住分析表明在5个表住区共发生16个氨基酸的突变.同源性分析显示与HB-HA2015毒株的同源关系最近,序列相似性为99.2％,与2010年以来国内外代表变异毒株同源性较高,达到98.5％～98.8％,而与2010年以前的传统同源性较低,在93.2％～95.6％之间;进化树分析显示该毒株与近年来国内外流行的变异毒株属于同一群,并且与HB-HA2015形成一小的分支,而与传统毒株进化距离较远.