福建地区猪瘟病毒流行株基因分型及E2基因遗传变异分析

为了解福建地区2013-2014年猪瘟病毒(CSFV)流行毒株的分子生物学特性与变异规律,采集了福建地区多个猪场的40份疑似猪瘟样品,应用RT-PCR技术对E2基因的主要抗原编码区进行扩增及序列分析,其中31份为猪瘟阳性.序列分析结果表明,31株CSFV流行毒株之间核苷酸与氨基酸的同源性分别为78.5％～100.0％和82.2％～100.0％,与国内外分离株的核苷酸同源性为81.1％～98.9％,氨基酸同源性为79.8％～95.6％;遗传进化树分析表明,31株CSFV属于1.1和2.1亚群,其中23株为1.1亚型,8株为2.1b和2.1c亚群,没有发现2.2和2.3亚群毒株.氨基酸序列分析表明,流行株在免疫逃逸相关位点705,713,729和734位氨基酸发生变异,FJ02毒株B细胞表位关键位点771位氨基酸发生变异,表明福建地区CSFV流行毒株呈现遗传变异多样性.