大白猪基因组选择在不同应用策略下的比较研究

目前,基因组选择(genomic selection,GS)技术已经在种猪育种中开展,但为获得较高的收益,还需研究一些应用策略,如确定仔猪基因分型个体比例和早期仔猪留种比例.本试验选择温氏集团出生于2011-2016年的大白种猪作为研究对象,共有超过4.5万条的生长测定记录,超过7万条繁殖记录,和2 090个个体的简化基因组测序(GBS)数据,其中,出生于2016年7～12月的440个体作为候选群体.研究性状包括两个生长性状(校正100kg日龄和校正100 kg背膘厚)和一个繁殖性状(总产仔数).为对比预测效果,在候选群体进行育种值预测时,按照是否利用其基因型或表型信息分为4种预测方案,比较不同方案的预测可靠性和个体选择指数的排名情况.结果 显示,在预测候选群育种值时,利用其表型或基因型信息均比不利用时的预测结果更加可靠.对生长性状终测前、后进行基因组选择指数计算,发现,终测后指数排名前30％的个体都位于终测前指数排名前60％内.若仔猪出生后仅选择常规BLUP预测指数排名前60％的个体,会导致有接近15％的具有优秀潜力的个体被遗漏.本研究建议,对所有新生健康仔猪都进行基因分型并计算基因组选择指数,然后对指数排名靠前60％的个体进行性能测定.