新疆野兔DNA条形码筛选
wf（2020）
摘要
旨在筛选一种用于快速鉴定新疆兔属物种的DNA条形码.本研究以新疆4种野兔共计40例样本为研究对象,以CO1、ND4、16S rRNA和ITS2为候选基因,经PCR扩增和测序后,综合分析比较候选序列在种水平上的鉴定能力.结果 表明,ITS2候选片段因未获得达到测序要求的PCR扩增产物最先被排除.相较于16S rRNA,CO1和ND4在序列特征、变异特征参数和秩和检验结果上均表现出更强的变异水平,遗传频率分布图有着更宽的gap,系统聚类树的鉴定结果有着更高的鉴定准确率.而从种间变异特征、种间秩和检验结果及遗传频率分布图来看,ND4均略优于CO1.本试验综合分析得到的最优DNA条形码为ND4,候补DNA条形码为CO1.该结论可为新疆兔属物种的分类分布研究和珍稀野兔资源的保护利用等提供一定的参考依据.
更多关键词
CO1,ND4,16S rRNA,ITS2
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