基于转录组测序筛选鼠伤寒沙门菌hfq基因缺失菌的差异表达基因

旨在鼠伤寒沙门菌 hfq基因缺失株转录组测序中分析适应环境变化及细菌分泌通路,筛选相关基因.通过使用实时荧光定量 PCR对鼠伤寒沙门菌 hfq基因缺失株转录组测序结果进行验证,从而对鼠伤寒沙门菌 hfq基因缺失株的细菌趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路进行深入分析,筛选相关的重要调控基因.结果显示:在细菌趋化性通路中筛选出 yiaD、STM3138 、STM3216和 malE等 4个共表达基因;在细菌分泌通路中筛选出φaP 、invA、ρrgH、invE、spaS、invG和 ssaV等 7个共表达基因;在细菌双组分通路中筛选出 ybfM、htrA、pagO、STM3138 、STM3031 、ttrB 、hiLD、pstS、STM1530 、hilA、ρgtC、hydH、ρd 、STM3216 、ttrR和 fljB等 16个共表达基因.在鼠伤寒沙门菌 hfq基因缺失株的趋化性通路、细菌双组分通路、细菌分泌通路中筛选出差异表达基因,hfq能够对这些基因进行调控,从而影响如运动性、毒力等相关作用,为沙门菌中的 sRNA与 hfq后续研究及沙门菌的防治奠定一定基础.