东北地区3株猪细小病毒7型毒株基因组测定及遗传进化分析

CHINA ANIMAL HEALTH INSPECTION(2018)

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Abstract
从东北地区采集的150份猪肺脏样品中,检测出3株猪细小病毒毒株.根据PPV7标准株NCBI登录号KU563733设计3对引物,对3个病毒株的基因片段进行扩增测序,将测序结果依次进行拼接,获得3个病毒株的NS1和CP基因序列,然后进行序列的同源性比对及进化树分析.结果显示:3个毒株的NS1基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为94.4%~95.2%、94.1%~95.1%和93.5%~94.3‰CP基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为89.6%~91.8%、89.8%~92.0%和89.6%~91.7%.通过进化树比对分析,确认3株PPV毒株为PPV7亚型.通过对其他病毒进行检测,发现PPV7与PCV2、PPV2的混合感染率较高.该分析结果为我国东北地区猪病防控提供了依据.
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