狼山鸡保种群不同世代MHC BF基因遗传多样性研究

Chinese Journal of Animal Science(2018)

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Abstract
通过Illumina平台Miseq重测序方法分析不同世代(G0、G5、G10、G12、G14、G15、G17)的MHC BF1和BF2基因座位多态性,揭示狼山鸡不同世代间MHC BF基因遗传多样性,为更好地监测保种效果提供科学的决策依据.在狼山鸡7个世代中分别鉴定出MHC BF1、BF2基因59和34个SNPs.狼山鸡MHC BF1基因观察杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)在G10、G12、G14保持稳定,Ho在不同世代变化情况为G17>G15>G14、G12、G10>G5>G0,He和PIC在不同世代变化情况为G17、G15>G14、G12、G10>G5> G0,MHC BF2基因的Ho在G10、G14、G15保持稳定,其他世代变化情况为G17、G12>G15、G14、G10>G0、G5;He和PIC在G12、G14、G15和G17保持稳定,在其他世代变化情况为G17、G15、G14、G12>G10>G5、G0.从本研究结果看,狼山鸡不同世代MHC BF1和BF2遗传多样性变化规律不太一致,但总体规律符合波动选择(时空变换的选择)假说,随着时间的推移MHC BF基因遗传多样性变得更为丰富,在某些连续几个世代群体遗传多样性基本保持稳定,这可能与MHC BF基因功能有关.
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MHC,Conservation,Genetic diversity,Chicken
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