基于线粒体DNA D-loop序列分析彭县黄鸡遗传多样性及其起源进化关系

研究旨在探究彭县黄鸡的遗传多样性和起源.通过对30只彭县黄鸡线粒体DNA (mtDNA) D-loop区高变区部分序列的PCR扩增、测序和比对,结合GenBank已经测出D-loop区全序列的部分品种鸡的序列,探讨彭县黄鸡的遗传多样性和母系起源.结果表明:测出的高变区部分序列长度为504～506 bp,12只为504bp(484 bp处T碱基缺失),1只为506 bp(498 bp处C碱基插入)外,其余均为505 bp.在30只个体中,共发现15处单核苷酸多态位点,由此界定7种单倍型.系统发育分析发现,彭县黄鸡7种单倍型可以分为A、B、C三个分支.综上,彭县黄鸡mtDNA D-loop区具有较为丰富的多态性,并且3个母系起源,研究结果从分子水平上为彭县黄鸡的遗传资源保护和开发利用提供了参考.