鸡TLR3、TLR4和TLR21单核苷酸多态性的生物信息分析

Jian ZHANG,Wenwen HAO, Lu LIU,Chuansheng ZHANG,Yaqi WANG,Huanhuan ZHANG,Liying GENG,Xianglong LI

China Poultry（2018）

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摘要

试验旨在筛选鸡TLR3、TLR4和TLR21基因中的功能性nsSNPs.利用SIFT、PolyPhen-2、PANTHER、PMut和PROVEAN五种软件方法分析引起的氨基酸替换nsSNPs是否可能影响基因的功能.进一步对三个基因氨基酸序列进行翻译后修饰位点及进化位点保守性的预测,使用easymodeller和SWISS-MODEL构建了其野生型及突变型蛋白质的空间结构,并计算突变前后的RMSD.结果表明:TLR3的K240T、T767S、D849N,TLR4的F427V、K714R和TLR21的T455A、Y553H、L602P、W926S可能严重影响蛋白质的结构功能.

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