三穗鸭Bmal1基因多态、表达差异与生物信息学分析
China Poultry(2017)
Abstract
通过研究贵州三穗鸭损伤表皮调节因子(Bmal1)基因的多态性,寻找其SNP多态位点及分析其在组织中的表达差异.利用PCR-SSCP技术与直接测序技术相结合和荧光定量表达的方法对Bmal1基因进行SNPs位点筛选和遗传特性分析,根据测序结果拼接获得的序列对该基因mRNA相关生物信息学进行分析.贵州三穗鸭Bmal1基因第一外显子存在两处SNP位点,且在脑组织中的表达量最高,2-从CT值为1.4431.Bmal1基因突变前后的等位基因频率估算有差异,但其mRNA二级结构预测,蛋白质二、三级结构预测分析均无差异.在心、肝、肾、胸肌、腿肌、脑、眼七个组织中表达存在差异,且各组间差异显著.
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