单核细胞增生李斯特菌新型转录调控因子Lmo2672分子特征及其系统进化分析

Chinese Journal of Veterinary Parasitology(2019)

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Abstract
利用PCR方法扩增单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)野毒株SB5新型转录调控因子lmo2672基因,进行克隆、测序,对其编码蛋白的二三级结构、理化特性、蛋白结构域等分子特征进行预测分析,并进行系统进化分析.结果显示:LM-SB5 lmo2672基因全长807 bp,共编码268 aa;二级结构预测发现,该蛋白含有1个DNA结合域(185~259 aa),2个由螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix)构成的HTH-18结构域(184~198 aa,226~249 aa),位于整个蛋白的C端,无信号肽序列及跨膜结构;序列比较发现,Lmo2672属于AraC家族转录调节蛋白,其核苷酸序列与NTSN株(4b型)同源性为99.63%;与国际标准株EGD-e株(1/2a型)的同源性为97.77%;系统进化树显示,LM-SB5lmo2672核苷酸序列与谱系II型NTSN等菌株亲缘关系较近,而与谱系I型菌株标准株EGD-e等亲缘关系较远.该研究结果为下一步探讨lmo2672基因在LM毒力和环境应激中的调控作用奠定了理论基础.
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