猪瘟野毒E2基因同源性比较

以人工感染发病猪的脾为材料提取总RNA,根据已报道的猪瘟病毒基因组序列,设计合成了2对引物,以总RNA为模板,利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)、套组聚合酶链式反应(nPCR)及测序技术,对流行于我国甘肃省、陕西省、宁夏和广西自治区的5株野毒株的主要外膜糖蛋白E2基因的核苷酸序列进行了测定,用DNAstar软件比较分析了5株野毒之间及其与猪瘟兔化弱毒株(C-ST株)E2基因的核苷酸序列和推导的氨基酸序列的同源性.结果发现,5株野毒与C-ST株核苷酸序列的同源性为81.7%～83.1%,氨基酸同源性为87.3%～88.6%,表明它们之间存在较大的差异;但5株野毒之间核苷酸序列的同源性高达98.8%～99.3%,氨基酸同源性为96.6%～99.2%,表明它们之间的差异较小.