基于16S rRNA高通量测序研究氨苄西林钠对SD大鼠肠道菌群结构的影响

Acta Ecologae Animalis Domastici(2020)

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摘要
通过16S rRNA高通量测序技术研究抗生素对SD大鼠肠道菌群多样性和结构的影响.SD大鼠40只随机分为4组:空白对照组(M0)10只、抗生素1周(M1)10只、抗生素2周(M2)10只,抗生素3周(M3)10只.其中空白组使用生理盐水灌胃,1 mL/次,2次/d,抗生素组用0.031 g/mL的氨苄西林钠,1 mL/次,2次/d灌胃,分别在1d、7d、14d、21d处死M0、M1、M2、M3组的10只SD大鼠,收集大鼠肠道内容物.提取样本DNA进行16S rRNA高通量测序并分析.结果 表明,抗生素不同用药时长与空白对照组的肠道菌群的结构存在明显差异.与M0组相比,M1组的大鼠肠道菌群摩根氏菌属(Morganella)的丰度上升,苏黎世杆菌属(Turicibacter)丰度下降;M2组的大鼠肠道毛螺菌属(Lachnospiracea_incertae_sedis)丰度上升,Terris porobacter丰度下降;M3组差异最小;抗生素能引起尿素循环降低和甲酰基—四氢叶酸的生物合成途径的升高.研究结果表明,广谱类抗生素氨苄西林钠破坏肠道菌群的稳态,能增加结肠息肉和抑郁症等疾病的风险,但在白血病和帕金森疾病上有潜在治疗价值.
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