盐津乌骨鸡mtDNAD-loop区遗传多样性及其保种效果分析

为阐明盐津乌骨鸡的群体遗传背景和评估、监测其保种效果,采用PCR产物直接测序对保种群样品进行了mtDNA控制区的变异检测,并结合已发表的云南其他地方鸡数据进行了群体遗传学分析.结果 表明,在所检测的2005年样品中,共发现40个核苷酸变异位点,其中32个为简约信息位点,8个为单一信息位点;共定义27种单倍型,单倍型多样度为0.939,核苷酸多样度为0.01595,群体内遗传距离为0.016;包含A、B、C、E、F和G等6个母系世系,所占比例分别为35.44％、3.80％、6.33％、10.13％、6.33％和37.97％.在所检测的2018年样品中,发现24个核苷酸多态位点,其中5个为单一信息位点,19个为简约信息位点;共发现到13种单倍型,单倍型多样度为0.847,核苷酸多样度为0.01118,群体内遗传距离为0.011;包含A、B、E和G等4个母系世系,所占比例分别为31.67％、10.00％、50.00％和8.33％.研究结果提示,两种样品群体遗传组成存在较大差异,2018年保种群遗传多样性水平比2005年的显著下降,群体中母系世系减少,存在较大比例外来鸡种的基因渗入,保种效果欠佳.