基于线粒体Cytb DNA阿拉善马鹿分子系统学研究

阿拉善马鹿为国家Ⅱ级重点保护野生动物,仅分布于宁夏和内蒙古交界的贺兰山中段,是我国唯一幸存的该亚种的有效种群.目前关于野生阿拉善马鹿的分子研究尚属空白,本研究于2016年8-9月和2017年2-3月在贺兰山采集新鲜阿拉善马鹿粪便样本396份,使用线粒体Cytb区DNA引物对提取的DNA进行物种鉴定和9对微卫星引物对其个体识别,共鉴定出278个阿拉善马鹿个体,基于线粒体Cyt b DNA对其全序列进行分析.使用线粒体Cyt b区引物对提取的粪便DNA扩增,获得了1 075 bp的序列,检测到10个变异位点,并定义了10个单倍型.其中10个变异位点占分析长度的0.93％,均为碱基代换,无碱基插入和缺失.其单倍型多样性为0.243,核苷酸多样性为0.000 32.中性检验Tajima's D值为显著负值,Fu和Li's D值为不显著的负值,表示阿拉善马鹿可能经历瓶颈事件并随后出现种群扩张.在系统发育树中,阿拉善马鹿单独聚成一支且与东北马鹿亲缘关系较近,与其他中国马鹿亚种亲缘关系较远.本研究表明野生阿拉善马鹿种群总体遗传多样性较低,建议加强对该亚种的保护力度.