猪流行性腹泻病毒贵州株M全基因遗传变异分析

为了解贵州省猪流行性腹泻病毒(PEDV)新流行毒株的遗传变异情况.本试验对贵州省2017年6月采集20份腹泻样本进行PEDV检测,并选取其2株PEDV M基因进行克隆和遗传进化分析,取名为GZFQ06-2017.结果显示,贵州省PEDV M基因与GenBank公布的26株参考序列(除韩国毒株SM98)的核苷酸相似性为94.0％～95.2％,与中国福建CH/FJZZ-9/201毒株和中国海南CH/HNQX-3/14毒株核苷酸相似性最低,为94.0％,与中国江苏SQ2014毒株核苷酸相似性最高,为95.2％;从遗传进化树可以看出,除韩国毒株SM98外,2017年6月贵州省PEDV流行毒株GZFQ06-2017与韩国疫苗株Attenuated DR13、中国江苏SQ2014和中国四川SC 1402毒株同在一分支上,其亲缘关系较近,与中国湖北CH-hubei-2016和中国云南CH/YNKM-8/2013亲缘关系较远.