猪流行性腹泻病毒山西分离株M基因序列分析

为了研究山西地区猪流行性腹泻病毒M基因的遗传变异情况,从2014年10月～ 2015年4月山西地区11个地市收集的猪流行性腹泻病毒(PEDV)病料中扩增到4株PEDV的M基因,并进行序列比对及遗传分析.结果表明,4株PEDV的M基因与CV777毒株比较,部分核苷酸及氨基酸发生改变.4株PEDV的M基因核苷酸和氨基酸的同源性分别为99.6％ ～ 100％和99.1％ ～99.6％,与参考毒株的核苷酸和氨基酸的同源性分别为96.3％ ～ 99.9％和96.0％ ～ 99.1％.遗传进化分析显示,4株PEDV与2010-2013年中国分离株(BJ2010、HB/BD、HB/FN、HLJ-2012、GDHZ-1202、SHQP/YM/2013)、2008年泰国KU04RB08株亲缘关系较近;与2株泰国株(M_NIAH2013_95和M_NIAH1795_04)、2株欧洲株(CV777和Br1/87)和2006年中国分离株LZC亲缘关系较远.