青海巨型住肉孢子虫线粒体cox1基因的克隆及进化分析

为了研究青海省巨型住肉孢子虫线粒体细胞色素C氧化酶第一亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)的遗传变异情况,并用pcox1序列构建巨型住肉孢子虫与其他住肉孢子虫的种群遗传关系.利用PCR技术扩增巨型住肉孢子虫的pcox1,将测序所获序列进行比对,并进行同源性分析和系统发育树的构建.结果显示,所获得的pcox1序列长度均为968 bp,与GenBank已公布的巨型住肉孢子虫相似度为99.1％～99.8％.系统发育树表明,所有分离株与已知巨型住肉孢子虫位于同一分支.巨型住肉孢子虫pcox1序列种内相对保守(0.2％～0.7％),种间差异较大(6.8％～20.8％),可用作种间遗传变异研究的标记.