贵州兴义鸭线粒体DNA条码分析

目的 试验旨在通过对贵州兴义鸭进行深入研究,利用COI基因序列作为DNA条形码对兴义鸭进行分子鉴定,分析其遗传多态性并探讨DNA条形码在贵州鸭品系分子鉴定工作的可行性和有效性.方法 以41只兴义鸭为研究对象,利用DNA直接测序法测定DNA条形码区COI基因序列,MEGA 6软件和Chromas软件筛查COI基因多态位点,然后DNASP 5软件计算COI基因的遗传特性评价指标.结果 兴义鸭COI基因存有8个多态位点,分别是G92A、G98A、A296G、C308T、G350A、G407A、T437C和A674G;共检测到12种单倍型:GAACGGTA、AAGTAACG、GAACAGTA、AGGTA-ACG、AGGTAGCG、AAACGGCA、AAACGGTA、AAATAACG、AACCAGCG、AAGTGGCA、AAATGGCA和AAGTAGCG;平均单倍型多样度为0.837,12种单倍型的遗传距离范围为0.002～0.012,平均遗传距离为0.005,Tajima's D(中性检验值)值为2.90350,统计显著性达到极显著水平(P<0.01),不符合中性突变.兴义鸭中12种单倍型共分为3个分支,其中第11种单倍型独成一个分支,单倍型2、4、5、8、9、10、12作为别一支,单倍型1、3、6、7作为另一分支,且该分支与GenBank中的6个家鸭品种共为一支.兴义鸭12种单倍型与融水鸭、西林鸭、绍兴鸭、北京鸭、龙盛鸭和建昌鸭无交叉的现象.结论 COI基因序列可以作为DNA条形码对贵州兴义鸭进行分子鉴定,能够将贵州兴义鸭和其他品种鸭品系区分开来,从而鉴定出兴义鸭.