猪E2F3基因3'UTR双荧光素酶报告基因质粒构建及其与miR-10a-5p的靶向验证

Heilongjiang Animal Science and Veterinary Medicine(2020)

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摘要
为了鉴定miR-10a-5p与猪E2F3基因的靶向关系,试验从生物信息miRNA Base数据库查询miR-10a-5p的相关信息,并运用MEGA 6.0软件分析其保守性,通过Target Scan生物信息学网站预测其潜在的靶基因及结合位点,然后PCR扩增E2F3基因3'非编码区(3'UTR)片段,构建E2F3的野生型(E2F3-3'UTR-wt)和突变型(E2F3-3'UTR-mut)双荧光素酶报告基因质粒,并分别与miR-10a-5p mimics、mimics NC共转染至293T细胞中,检测双荧光素酶活性变化.结果 表明:miR-10a-5p在7个物种间具有高度保守性,成熟序列均为UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGU;Target Scan生物信息学网站预测到miR-10a-5p具有包括E2F3基因在内的共241个潜在的靶基因;E2F3基因片段经PCR扩增获得大小约1 288 bp的清晰条带,测序结果与预期一致;转染miR-10a-5p mimics能显著降低猪E2F3基因野生型质粒双荧光素酶活性(P<0.05).说明猪E2F3基因3'UTR双荧光素酶报告基因质粒构建成功,且其与miR-10a-5p之间存在靶向关系.
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