金川牦牛TGF-β1基因克隆及蛋白质结构分析

为了探讨金川牦牛天然免疫调节因子TGF-β1基因特点,试验根据GenBank公布的野牦牛序列设计引物,并运用ExPASy、ABCpred、BIMAS等生物信息学软件对基因序列进行核酸和蛋白质结构分析.结果表明:克隆的金川牦牛TGF-β1基因片段长度为607 bp,开放阅读框为471 bp,可编码157个氨基酸,其中丙氨酸、脯氨酸的含量最多,分别达14.01％、12.10％.分子质量为16.32487 ku,理论等电点为9.48,不稳定系数为63.90.二级结构以无规则卷曲为主(64.33％).TGF-β1基因存在潜在的抗原表位,B细胞有77～92,99～114,121～136等17个表位区域,T淋巴细胞有2～10,19～27,68～76,126～134等20个表位区域.系统进化分析中,金川牦牛TGF-β1基因与野牦牛同源性为96.7％,亲缘关系最近.试验获得金川牦牛TGF-β1基因,在哺乳动物中具有较高的保守性.