家鸽及边鸡的MC1R基因片段的克隆及分析

为了研究黑素皮质素受体1 (MC1R)基因与家鸡、家鸽羽色的相关关系,根据GenBank上原鸡MC1R基因序列,利用在线引物设计软件Primer3(V.0.4.0)在编码区设计1对引物PE,试验以家鸽和边鸡DNA为模板,PCR扩增,测序,分别获得长度为303 bp和335 bp的基因片段.结果表明:家鸽与原鸡MC1R基因核苷酸序列存在10处变异,边鸡与原鸡存在3处变异,其序列相似性分别为95.71％、99.10％.二级结构分析结果表明,家鸽和边鸡α螺旋、β折叠、无规则卷曲所占比例分别为47.92％、31.25％、20.83％,64.80％、21.90％、13.30％,均有2个跨膜区.针对2个物种氨基酸序列同源与变异预测其三级结构,结果表明,MC1R基因可能是表达禽类羽色的主效基因.