高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5蛋白B细胞表位预测与分析

Heilongjiang Animal Science and Veterinary Medicine（2014）

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摘要

为了预测高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(HP-PRRSV) GP5蛋白B细胞表位,试验以HP-PRRSV GP5基因组序列为基础,采用Kyte-Doolittle方案、Emini方案和Jameson-wolf方案,辅以Gamier-Robson方法、Chou-Fasman方法和Karplus-Schulz方法对HP-PRRSV GP5蛋白的二级结构柔性区域进行分析,预测HP-PRRSV GP5蛋白B细胞表位,并与相关文献报道的表位进行比对.结果表明:最有可能的B细胞表位位于GP5蛋白N端第31 ～37,51 ～ 56,136～141,148～156,163 ～ 166,193 ～ 200区段,并发现了新的表位.

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