美洲水貂EDNRB基因启动子克隆与生物信息学分析

Heilongjiang Animal Science and Veterinary Medicine(2019)

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Abstract
为了克隆出水貂EDNRB基因的启动子区域,预测该片段的核心启动子区域、CPG岛、顺式作用元件及转录因子结合位点,为水貂EDNRB基因的表达调控研究提供理论依据,试验采用PCR扩增、克隆及生物信息学方法进行了研究.结果 表明:克隆出的长为1 830 bp的水貂EDNRB基因候选启动子序列,经检验与人的EDNRB基因序列有高度的同源性;在此段序列中利用在线软件成功预测出多个核心启动子区域,2个CPG岛区域,3个GAAT框,1个GC框,6个TATA框,并提示存在MEF2、NF-1、Sp-1等转录因子结合位点.说明水貂EDNRB基因的-1 763/+67 bp候选启动子区域可能受到甲基化影响,同时也受顺式作用元件与转录因子的调控作用.
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