基于线粒体COI和Cytb基因序列的6种锦鲤(Cyprinus carpio Koi)遗传多样性分析

Freshwater Fisheries(2018)

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摘要
实验利用线粒体COI基因和Cytb基因的片段序列分析比较了黑锦鲤(Cyprinus carpio Karasugoi Koi)、三色锦鲤(C.carpio Taisho Sanshoku Koi)、红白锦鲤(C.carpio Kohaku Koi)、黄金锦鲤(C.carpio Kigoi Koi)、全白锦鲤(C.carpio Platinum Ogon Koi) 和全红锦鲤(C.carpio Higoi Koi) 6个锦鲤(Cyprinus carpio Koi)养殖品系的遗传多样性和系统进化关系.结果显示:基因序列分析得到的单倍型数分别为7、6.6个品系均具有较高的单倍型多样性指数和较低的核苷酸多样性指数.群体间遗传分化系数Fst、遗传距离和AMOVA等结果显示品种间变异高于品种内变异,黑锦鲤和黄金锦鲤间、红白锦鲤和三色锦鲤间不存在显著遗传差异,其余品系间差异显著.根据COI和Cytb基因单倍型构建的品系间NJ系统进化树得到相同结果,黑锦鲤和全红锦鲤遗传关系较近,聚为一支.三色锦鲤、红白锦鲤和黄金锦鲤遗传关系较近,聚为一支.全白锦鲤与其他品系的亲缘关系均较远,单独形成一个分支.
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