独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼TRPV1基因的克隆及低温适应功能检测

为从细胞水平上研究独角雪冰鱼Chionodraco hamatus 和伯氏肩孔南极鱼Trematomus bernacchii 的低温适应能力,采用RT-PCR方法,获得独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼的瞬时受体电位阳离子通道蛋白( transient receptor potential channels V1, TRPV1)基因序列,其开放阅读框全长均为2310 bp；生物信息学分析表明,两种南极鱼 TRPV1基因均编码769氨基酸残基,预测其蛋白相对分子质量分别为88210和88160,理论等电点分别为7.63和8.26；两种南极鱼TRPV1蛋白均无信号肽；亚细胞定位显示, TRPV1蛋白主要在细胞膜和内质网中发挥生物学功能；理化性质分析表明,两种南极鱼的TRPV1为不溶性跨膜蛋白,分别有34、35个磷酸化位点和6、5个糖基化位点,二者均含有6个跨膜结构域、5个锚蛋白结构域,二级结构以随机卷曲为主；同源性分析显示,独角雪冰鱼TRPV1氨基酸序列与伯氏肩孔南极鱼的一致性最高,为93.4%,与其他物种的一致性为44.3%~69.8%；低温适应试验结果显示,两种南极鱼的TRPV1基因不能被温度所激活。研究表明,独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼TRPV1基因可能与低温适应无关。