复合性状的QTL定位模型构建

Journal of Nanjing Forestry University(Natural Science Edition)(2018)

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Abstract
[目的]传统复合性状的QTL(quantitative trait locus)定位方法仅仅利用两个或几个构成性状的计算值作为表型值,未考虑复合性状的生物学内涵,从而影响定位的准确性.因此,发展适合于复合性状的QTL定位模型,对于深入解析控制复合性状的遗传结构,进而提高基因定位准确性显得越来越重要.[方法]针对全基因组重测序数据,构建了一个复合性状QTL定位模型(composite traits mapping model,CTM),利用CTM对复合性状进行分解,把分解后的组分以二元或多元正态分布形式整合到QTL作图的框架内.[结果]应用CTM分析杨树材积生长数据,可成功定位到大量与杨树材积生长相关的基因,并与传统方法进行了比较,定位出较多的显著位点,表现出较好的性能.计算机模拟试验表明,所构建的CTM模型在定位复合性状QTL中具有较高的效力,在达到一定的样本数量和遗传力条件下,CTM模型具有较强的效力,样本量和遗传力的增加都能够增加参数估计的精度.[结论]CTM模型有助于复合性状遗传结构的解析,促进林木分子标记辅助育种的开展.
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