马尾松水通道蛋白PmPIP1基因克隆及在干旱胁迫下的表达分析
wf(2016)
摘要
克隆马尾松Pinus massoniana水通道蛋白(AQP),并对其生物信息学与干旱胁迫表达模式进行分析。采用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)以及互补脱氧核糖核酸(cDNA)末端快速扩增(RACE)方法克隆马尾松水通道蛋白基因。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)分析其在干旱胁迫下的响应模式。结果克隆到一个马尾松水通道蛋白基因,命名为PmPIP1(GenBank登录号为KF582038)。此基因cDNA全长序列为1301 bp,包括867 bp的完整开放阅读框,99 bp 的5′末端非翻译区和335 bp 的3′末端非翻译区。编码288个氨基酸残基,分子量为30.86 kD,等电点(pI)8.48。 PmPIP1与菠菜Spinacia oleracea (2b5fA)水通道蛋白结构相似。 PmPIP1含有6个跨膜区,具有膜内在蛋白(MIP)家族信号序列、高等植物高度保守序列HINPAVTFG和2个天门冬酰胺-脯氨酸-丙氨酸(NPA)保守肽段。 PmPIP1基因属质膜内在蛋白(PIPs)亚族,与挪威云杉Picea abies 水通道蛋白基因亲缘关系最近,同源性达95%。 qRT-PCR表明PmPIP1受干旱胁迫诱导表达。马尾松PmPIP1的克隆丰富了植物AQP基因的资料库,同时推测PmPIP1基因可能参与了马尾松干旱胁迫过程。图8表1参39
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