水稻亚硒酸盐转运子OsNIP2;1及其家族成员的蛋白结构分析

Acta Agriculturae Universitatis Jiangxiensis(Natural Sciences Edition)(2018)

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摘要
OsNIP2;1是水稻亚硒酸盐转运子,是类NOD26内在蛋白家族的成员.本研究从GenBank数据库检索获得水稻、玉米和拟南芥的NIP家族成员氨基酸序列信息,利用生物信息学方法对OsNIP2;1及其家族成员的蛋白理化性质、蛋白结构进行分析,对3种植物NIP家族成员的同源和进化关系进行评估.研究结果表明,OsNIP2;1是定位于细胞质膜中的疏水性跨膜蛋白,包含6个跨膜结构域,其二级结构由38.26%的α螺旋、21.48%的延伸带、10.40%的β转角和29.87%的随机卷曲等构成;OsNIP家族的其他成员都与OsNIP2;1具有类似的蛋白理化性质和结构;3种植物NIP家族成员的同源性很高,其氨基酸序列比对和进化树都显示出进化过程的高度保守性.
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