马铃薯纺锤块茎类病毒云南分离物的序列分析

[目的]了解云南省马铃薯纺锤块茎类病毒分子变异情况及其致病机制.[方法]以采自云南2个不同地方疑似马铃薯纺锤块茎类病毒病的块茎为材料,对其提取总RNA、反转录为cDNA,利用特异性引物进行RT-PCR检测,扩增产物经纯化后克隆并测序.[结果]扩增产物全长357 bp,分别命名为PSTVd-Dasongping-YN (KX159281)和PSTVd-LiangheYN (KX159282).将这2个分离物与国内外已报道的PSTVd株系全序列构建系统发育树,并与已报道的PSTVd弱毒、中毒和强毒株系进行序列比对和二级结构预测,表明PSTVd-Da-songpingYN和PSTVd-LiangheYN与PSTVd弱毒株系更接近.[结论]PSTVd-DasongpingYN和PSTVd-LiangheYN的序列相似性为97.5％,存在9个碱基差异,且主要集中在可变区(V)和右末端区(TR),说明云南不同地方分离物PSTVd也存在差异.PSTVd-DasongpingYN和PSTVd-LiangheYN属于PSTVd的弱毒株系组.