茶树 龙井43"叶绿体基因组测序及其系统进化（英文）

利用高通量测序技术对中国茶树品种?龙井43"叶绿体基因组的全序列进行测定,拼接补洞后再利用Sanger测序法对序列进行验证,最终得到?龙井43"叶绿体基因组全序列( GenBank登录号：KF562708.1).该基因组大小为157085 bp ,其中大单拷贝区的长度为86642 bp ,小单拷贝区的长度为18283 bp ,反向重复区的长度为26080 bp ,共注释叶绿体基因134个.与韩国茶树品种叶绿体基因组序列比对,在编码区发现15个基因发生了非同义突变,在非编码区有100多个多态性位点,这些突变可作为茶树品种鉴定的DNA标记.同时,选取12个中国茶树品种,对其叶绿体基因组上的特异性片段( ycf1,psbA-trnH ,psbK-psbI-psbI)进行测序比对并构建系统进化树.结果表明：12个茶树品种在进化树上分为2个亚群,其中?凌云白毛茶"单独形成一支,其他11个品种形成一支；而11个品种中,?龙井瓜子"?龙井长叶"?龙井圆叶"?中茶102"形成一支,自展支持率为100％.表明利用叶绿体基因片段可有效区分茶树品种间的亲缘关系.