莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2的遗传多态性

以莆田黑鸭为材料，对其主要组织相容性复合体( MHC)Ⅰ基因外显子2进行PCR扩增和DNA测序，分析其遗传多态性及变异特征，为进一步寻求抗病分子提供依据.结果表明，莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2处有丰富的遗传多态性，核苷酸变异以颠换为主，同义替换率大于非同义替换率，总 GC 含量较高，为59％，其中，密码子第3位的 GC 含量最高，为82.7％.莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2编码的氨基酸有明显的疏水性，对维持MHC分子的结构和功能具有重要作用.聚类分析结果表明，禽类分支中，莆田黑鸭与家鹅的亲缘关系较近，与鸡的亲缘关系较远.