狗牙根抗寒相关性状与分子标记的关联分析

利用152份狗牙根材料在抗寒性上的差异,采用关联分析的方法鉴定与抗寒性状关联的分子标记。结果表明,采用基于数学模型的聚类方法分析狗牙根遗传结构,当群体数目k =4时模型,后验概率 LnP(D)最大并有比较稳定的α值,可将供试材料分开,存在亚群结构。利用 SSR、EST-SSR分子标记对狗牙根基因组 LD结构进行粗略估计,159个 SSR、EST-SSR标记中共检测到6554个成对位点组合存在连锁不平衡,占所有可能成对位点组合的38.8%,其中237个成对位点组合存在较高程度的连锁不平衡(D'>0.5)。通过对遗传结构分析和调整,以各个个体相应的 Q值作为协变量,对 SSR位点变异进行分析,结果检测到11个位点(S24、S36、S27、S51、S59、S21、S110、S118、S105、S150、S158)的变异分别与抗寒性状相关(P <0.05)。