菜心种质资源遗传多样性的SCoT分析

[目的]利用SCoT标记分析菜心种质资源的遗传多样性,为其分类和利用提供理论依据.[方法]搜集熟期和株色各异的33份菜心种质资源,利用筛选的12条SCoT引物对其进行遗传多样性分析.[结果]12条引物从33份菜心共扩增出83条带,引物多态性百分率变化范围为2.63％～57.89％,平均多态性百分率为36.00％;每条引物多态性条带变化范围为4～9条,平均3.4条;扩增片段大小为500～1500 bp.观察等位基因数(Na)为1.065,有效等位基因数(Ne)为1.254,Shannon's信息多样性指数(Ⅰ)为0.217,期望杂合度(He)为0.149,平均Nei's遗传距离为0.428.AMOVA分析发现,81％的变异来源于品种内,19％的变异来源于品种间.聚类分析结果表明,在Nei's遗传距离0.24处可将33份菜心分成两大类,第一类包括14个早熟品种、2个中熟和1个晚熟品种;第二类包括10个中晚熟品种和6个早熟品种.[结论]SCoT标记的分类结果与熟期分类结果较一致,多数菜心品种可根据熟期和SCoT标记归类;SCoT标记具有操作简单、重复性高、多态性较丰富等优点,可用于菜心遗传多样性研究的初步批量检测.