西红花β-胡萝卜素羟化酶CsBCH1-z基因的分离与生物信息学分析
Chinese Agricultural Science Bulletin（2019）
摘要
为更好地理解西红花类胡萝卜素合成代谢途径,从西红花中分离和克隆了1个新的β-胡萝卜素羟化酶基因CsBCH1-z,并从柱头cDNA中克隆了该基因的全长编码序列为906 bp,编码301个氨基酸残基,对应的基因组序列为1261 bp,5个外显子由4个内含子子间隔开.与已知的CsBCH1基因的氨基酸序列比较,发现在N端由于6个碱基的缺失,造成了2个氨基酸的缺失和1个氨基酸由异亮氨酸突变为亮氨酸,另外还有一处单碱基的变异造成苏氨酸突变为丙氨酸.通过预测其蛋白含有3个明显的跨膜结构域,C端包含了2组“HXXXXH”和“HXXHH”结构域,是典型的脂肪酸羟化酶.β-胡萝卜素羟化酶是西红花苷合成的重要前体物质,CsBCH1-z柱头中的表达量＞叶片＞花瓣;雄蕊中表达很低;球茎中表达不可见.
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