白羊草BiCDPK基因保守区的克隆及序列分析
Chinese Agricultural Science Bulletin（2016）
摘要
为了研究CDPK基因的结构和功能,利用RT-PCR方法从白羊草中克隆得到BiCDPK基因,并对其进行生物信息学分析.结果表明:该BiCDPK基因cDNA长1048 bp,包含387 bp的开放阅读框,编码128个氨基酸.蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水,二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主.亚细胞定位于细胞质中,无跨膜结构域,无信号肽.蛋白序列中存在1个丝氨酸磷酸化位点和3个苏氨酸磷酸化位点.进化分析结果表明,克隆的BiCDPK基因与玉米、小麦和水稻具有较高同源性,相似度分别是97％、86％、86％.为进一步研究BiCDPK基因的功能奠定了基础.
更多关键词
Bothriochloa ischaemum,BiCDPK,gene clone
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